Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WHAMMP3Q1A5X7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WHAMMP3Q1A5X7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WHAMMP3Q1A5X7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms