Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LONRF1Q17RB8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LONRF1Q17RB8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LONRF1Q17RB8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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