Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK4Q16654 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDK4Q16654 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDK4Q16654 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms