Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGISQ16647 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGISQ16647 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGISQ16647 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGISQ16647 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms