Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB11BQ15907 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB11BQ15907 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms