Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6AP1Q15904 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6AP1Q15904 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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