Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPTX1Q15818 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPTX1Q15818 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NPTX1Q15818 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPTX1Q15818 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPTX1Q15818 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NPTX1Q15818 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPTX1Q15818 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPTX1Q15818 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPTX1Q15818 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPTX1Q15818 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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