Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SURF1Q15526 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SURF1Q15526 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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