Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIX1Q15475 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIX1Q15475 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIX1Q15475 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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