Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCP1Q15431 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP1Q15431 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP1Q15431 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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