Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELOBQ15370 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ELOBQ15370 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms