Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTF1Q15361 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTF1Q15361 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTF1Q15361 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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