Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1I3Q14994 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1I3Q14994 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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