Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMCO1Q147U7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMCO1Q147U7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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