Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H2Q13888 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H2Q13888 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H2Q13888 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms