Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA9Q13797 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA9Q13797 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA9Q13797 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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