Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL4BQ13620 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL4BQ13620 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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