Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRR1Q13601 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRR1Q13601 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms