Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA5AQ13591 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA5AQ13591 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms