Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2V1Q13404 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2V1Q13404 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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