Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTGDRQ13258 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGDRQ13258 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
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