Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNIP3Q12983 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3Q12983 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3Q12983 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms