Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BNIP1Q12981 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP1Q12981 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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