Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ANK3Q12955 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANK3Q12955 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANK3Q12955 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms