Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD3Q12873 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHD3Q12873 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHD3Q12873 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHD3Q12873 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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