Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYCNQ0VAF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms