Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPAL4Q0D2K0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL4Q0D2K0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms