Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC38A11Q08AI6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC38A11Q08AI6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms