Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN3Q08043 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN3Q08043 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms