Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SOS1Q07889 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SOS1Q07889 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SOS1Q07889 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms