Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR4Q05215 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR4Q05215 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR4Q05215 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms