Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCQQ04759 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCQQ04759 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCQQ04759 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms