Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBE1Q04446 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms