Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 TUP1YCR084C 2142 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YEL067CYEL067C 588 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YGR153WYGR153W 654 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 NSG1YHR133C 876 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 BUD28YLR062C 378 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 MRL1YPR079W 1146 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 UGA2YBR006W 1494 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 BUD22YMR014W 1560 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 MKC7YDR144C 1791 nt3.96□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 CAF4YKR036C 1932 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 MMT2YPL224C 1455 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 ENP1YBR247C 1452 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YPL245WYPL245W 1365 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 MNN10YDR245W 1182 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 RPL12AYEL054C 498 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 RPN12YFR052W 825 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 OST3YOR085W 1053 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 NHP6AYPR052C 282 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 TFC7YOR110W 1308 nt3.95□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 LHP1YDL051W 828 nt3.94□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YDR401WYDR401W 564 nt3.94□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 FAU1YER183C 636 nt3.94□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 PRE7YBL041W 726 nt3.94□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YCL012CYCL012C 405 nt3.94□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 ASA1YPR085C 1332 nt3.94□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 RMR1YGL250W 726 nt3.93□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 MRP21YBL090W 534 nt3.93□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 TRM10YOL093W 882 nt3.93□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YIL067CYIL067C 2037 nt3.93□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 IMD3YLR432W 1572 nt3.93□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt3.92□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YNL174WYNL174W 573 nt3.92□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 TOM5YPR133W-A 153 nt3.92□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 TUL1YKL034W 2277 nt3.92□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 PXA1YPL147W 2613 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 FRS1YLR060W 1788 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 TDA7YNL176C 1911 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 RPS16BYDL083C 432 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 CAX4YGR036C 720 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 JJJ3YJR097W 519 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 GAS3YMR215W 1575 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 CKB2YOR039W 777 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YHR182WYHR182W 2358 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 ADE6YGR061C 4077 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 KCH1YJR054W 1494 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YJR124CYJR124C 1347 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YMD8YML038C 1329 nt3.91□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 RVB1YDR190C 1392 nt3.9□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 PRO2YOR323C 1371 nt3.9□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 CRT10YOL063C 2874 nt3.9□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 NUP1YOR098C 3231 nt3.9□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 AFT1YGL071W 2073 nt3.9□□□□□ -1.78
YHP1Q04116 YER084WYER084W 387 nt3.9□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 LCP5YER127W 1074 nt3.9□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 MAP2YBL091C 1266 nt3.9□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 CUE5YOR042W 1236 nt3.9□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 BLM10YFL007W 6432 nt3.9□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 MPS3YJL019W 2049 nt3.9□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 TUB2YFL037W 1374 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 NOP7YGR103W 1818 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 SYP1YCR030C 2613 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 URA3YEL021W 804 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 CLF1YLR117C 2064 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 SNF3YDL194W 2655 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 PGM2YMR105C 1710 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 EEB1YPL095C 1371 nt3.89□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 AIR2YDL175C 1035 nt3.88□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 SUT1YGL162W 900 nt3.88□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 ECT1YGR007W 972 nt3.88□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 KAR2YJL034W 2049 nt3.88□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YTA6YPL074W 2265 nt3.88□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 TSL1YML100W 3297 nt3.88□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 BOP2YLR267W 1713 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 STE20YHL007C 2820 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YNL247WYNL247W 2304 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 SUP35YDR172W 2058 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 RRP45YDR280W 918 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 PUS6YGR169C 1215 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 GSP2YOR185C 663 nt3.87□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 SKG3YLR187W 3081 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 PMA1YGL008C 2757 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 PEX19YDL065C 1029 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 MRPL4YLR439W 960 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 COG5YNL051W 1212 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 PEX29YDR479C 1665 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 CLA4YNL298W 2529 nt3.86□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 NOC4YPR144C 1659 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 PSE1YMR308C 3270 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 ARO2YGL148W 1131 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YLR346CYLR346C 306 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 GMC1YDR506C 1827 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 MSS116YDR194C 1995 nt3.85□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 TOS3YGL179C 1683 nt3.84□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 SEC9YGR009C 1956 nt3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.7 ms