Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAX5Q02548 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX5Q02548 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms