Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
XPCQ01831 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
XPCQ01831 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
XPCQ01831 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
XPCQ01831 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
XPCQ01831 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
XPCQ01831 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
XPCQ01831 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
XPCQ01831 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
XPCQ01831 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
XPCQ01831 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
XPCQ01831 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
XPCQ01831 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
XPCQ01831 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
XPCQ01831 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
XPCQ01831 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
XPCQ01831 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
XPCQ01831 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
XPCQ01831 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
XPCQ01831 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
XPCQ01831 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
XPCQ01831 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
XPCQ01831 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
XPCQ01831 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
XPCQ01831 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
XPCQ01831 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
XPCQ01831 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
XPCQ01831 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
XPCQ01831 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
XPCQ01831 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
XPCQ01831 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
XPCQ01831 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
XPCQ01831 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
XPCQ01831 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
XPCQ01831 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
XPCQ01831 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms