Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB1Q01826 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SATB1Q01826 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms