Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DEFA6Q01524 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms