Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG4Q00888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG4Q00888 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG4Q00888 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG4Q00888 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG4Q00888 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms