Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBX1P62877 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBX1P62877 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBX1P62877 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBX1P62877 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBX1P62877 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBX1P62877 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBX1P62877 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBX1P62877 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms