Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTA2P62736 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTA2P62736 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms