Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS13P62277 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS13P62277 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS13P62277 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS13P62277 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS13P62277 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS13P62277 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS13P62277 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS13P62277 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS13P62277 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS13P62277 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS13P62277 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS13P62277 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS13P62277 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS13P62277 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS13P62277 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS13P62277 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms