Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB2AP61019 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB2AP61019 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms