Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF4A1P60842 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF4A1P60842 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF4A1P60842 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF4A1P60842 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF4A1P60842 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF4A1P60842 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF4A1P60842 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF4A1P60842 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF4A1P60842 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms