Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVFC1-1P60608 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms