Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCDC1P59894 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms