Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP3P57721 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCBP3P57721 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCBP3P57721 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCBP3P57721 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP3P57721 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP3P57721 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP3P57721 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP3P57721 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP3P57721 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP3P57721 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP3P57721 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms