Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBASH3AP57075 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3AP57075 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms