Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2BFSP57053 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2BFSP57053 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2BFSP57053 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms