Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX17P56962 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX17P56962 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX17P56962 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX17P56962 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX17P56962 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX17P56962 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STX17P56962 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STX17P56962 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STX17P56962 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX17P56962 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX17P56962 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX17P56962 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX17P56962 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX17P56962 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX17P56962 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX17P56962 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX17P56962 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX17P56962 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX17P56962 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX17P56962 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX17P56962 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX17P56962 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX17P56962 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX17P56962 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX17P56962 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX17P56962 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX17P56962 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX17P56962 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX17P56962 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms